Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pop5Q9DB28 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms