Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms