Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Atg7Q9D906 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms