Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Sgms2Q9D4B1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sgms2Q9D4B1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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