Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms