Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms