Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms