Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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