Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms