Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ubqln4Q99NB8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ubqln4Q99NB8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms