Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Tm2d1Q99MB3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms