Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ttc5Q99LG4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ttc5Q99LG4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms