Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RtcbQ99LF4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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