Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms