Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms