Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn4Q8VCH8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn4Q8VCH8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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