Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtf3c1Q8K284 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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