Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Polr1eQ8K202 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Polr1eQ8K202 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms