Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrit1Q8K099 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit1Q8K099 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms