Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms