Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Hpf1Q8CFE2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms