Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms