Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms