Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssc5dQ8BV57 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssc5dQ8BV57 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ssc5dQ8BV57 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssc5dQ8BV57 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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