Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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