Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Atg9aQ68FE2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atg9aQ68FE2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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