Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CltcQ68FD5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms