Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms