Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms