Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DbpQ60925 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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DbpQ60925 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DbpQ60925 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms