Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nr2f1Q60632 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms