Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Bbs12Q5SUD9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms