Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ctsll3Q3ULP7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms