Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q3U595 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q3U595 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms