Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rnf149Q3U2C5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms