Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hace1Q3U0D9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hace1Q3U0D9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms