Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Tmem52bQ0VBF2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tmem52bQ0VBF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms