Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
F13bQ07968 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms