Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Npas1P97459 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Npas1P97459 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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