Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Taf1bP97358 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Taf1bP97358 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Taf1bP97358 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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