Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rps11P62281 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms