Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vbp1P61759 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms