Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csrnp1P59054 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms