Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dpf3P58269 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms