Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VdrP48281 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
VdrP48281 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms