Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rom1P32958 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Rom1P32958 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms