Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
RxraP28700 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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RxraP28700 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
RxraP28700 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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