Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChgaP26339 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms