Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gabra6P16305 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms