Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms